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Diffhic
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅Diffhic。
HI-C数据的差分分析
生物导体版本：3.1
在HI-C实验中检测跨生物条件的差异相互作用。提供了用于读取和数据进行的读取和数据进行交互计数的方法。统计分析基于EDGER，并支持归一化和过滤。还提供了几种可视化选项。
作者：Aaron Lun
维护者：aaron lun
引用（从r内，输入引用（“ diffhic”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ diffhic”）
| R脚本 | Diffhic Vignette | |
| diffhicusersguide.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，聚类，，，，覆盖范围，，，，嗝，，，，多重组合，，，，正常化，，，，预处理，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.0.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（1年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.2.0），基因组机 |
| 进口 | rsamtools，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，RHDF5，，，，EDGER，，，，林玛，，，，CSAW，，，，Locfit， 方法，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.ecoli.ncbi.20080805 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | diffhic_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | diffhic_1.0.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | diffhic_1.0.1.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | diffhic_1.0.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/diffhic/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/diffhic/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
