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葡萄
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅葡萄。
Dexus-鉴定有未知条件或无重复的RNA -Seq研究中的差异表达
生物导体版本：3.1
Dexus在所有可能的研究设计中鉴定了RNA-Seq数据中差异表达的基因，例如无重复，没有样品组和未知条件的研究。Dexus也适用于已知条件，例如，对于具有两个或多个条件的RNA-Seq数据。RNA-seq读取计数数据可以由S4类计数数据集和读取计数矩阵提供。差异表达的转录本可以通过热图可视化，其中还指示未知条件，重复和样品组。该软件很快，因为核心算法是用C编写的。对于非常大的数据集，此软件包中提供了Dexus的并行版本。Dexus是一个由EM算法在贝叶斯框架中选择的统计模型。Dexus不需要重复来检测差异表达的转录本，因为复制（或条件）由EM方法估算为每个转录本。该方法提供了一个信息/非信息价值，可在所需的显着性水平或功率上提取差异表达的转录本。
作者：Guenter Klambauer
维护者：guenter klambauer
引用（从r内，输入引用（“ Dexus”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Dexus”）
| R脚本 | Dexus：R包的手册 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 细胞生物学，，，，分类，，，，差异性，，，，基因表达，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（3年） |
| 执照 | LGPL（> = 2.0） |
| 要看 | R（> = 2.15），方法，生物基因 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 平行，Statmod，统计deseq，，，，rcolorbrewer |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | dexus_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | dexus_1.8.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | dexus_1.8.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | dexus_1.8.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/dexus/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dexus/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
