要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ derfinder”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

德芬德

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅德芬德

基本对分辨率的RNA-seq数据的注释 - 敏捷差异表达分析

生物导体版本:3.1

该软件包提供了RNA-Seq数据的注释 - 敏捷差分表达分析的功能。

作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Alyssa C. Frazee [Aut],Andrew E. Jaffe [Aut],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]

维护者:leonardo collado-torres

引用(从r内,输入引用(“ derfinder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ derfinder”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ derfinder”)

html R脚本 Derfinder高级详细信息和用法
html R脚本 简介DERFINDER
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.2)
进口 AnnotationDbi(> = 1.27.9),生物比较,,,,Bumphunter(> = 1.7.6),derfinderhelper(> = 1.1.0),GenomeInfodB(> = 1.3.3),基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,Genomicfiles,,,,基因组机(> = 1.17.40),HMISC,,,,iranges(> = 1.99.28),QVALUE(> = 1.99.0),rsamtools,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS(> = 0.2.3)
链接
建议 Biovizbase,,,,DevTools(> = 1.6),derfinderdata(> = 0.99.0),GGPLOT2,,,,编织(> = 1.0.1),尼特(> = 1.6),Knitrbootstrap(> = 0.9.0),rmarkDown(> = 0.3.3),测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/lcolladotor/derfinder
BugReports https://github.com/lcolladotor/derfinder/issues
取决于我
进口我 derfinderplot,,,,地区报告
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 derfinder_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 derfinder_1.2.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) derfinder_1.2.1.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) derfinder_1.2.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/derfinder/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinder/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
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