要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ derfinder”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅德芬德。
生物导体版本:3.1
该软件包提供了RNA-Seq数据的注释 - 敏捷差分表达分析的功能。
作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Alyssa C. Frazee [Aut],Andrew E. Jaffe [Aut],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]
维护者:leonardo collado-torres
引用(从r内,输入引用(“ derfinder”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ derfinder”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ derfinder”)
html | R脚本 | Derfinder高级详细信息和用法 |
html | R脚本 | 简介DERFINDER |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.2.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.2) |
进口 | AnnotationDbi(> = 1.27.9),生物比较,,,,Bumphunter(> = 1.7.6),derfinderhelper(> = 1.1.0),GenomeInfodB(> = 1.3.3),基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,Genomicfiles,,,,基因组机(> = 1.17.40),HMISC,,,,iranges(> = 1.99.28),QVALUE(> = 1.99.0),rsamtools,,,,rtracklayer,,,,S4VECTORS(> = 0.2.3) |
链接 | |
建议 | Biovizbase,,,,DevTools(> = 1.6),derfinderdata(> = 0.99.0),GGPLOT2,,,,编织(> = 1.0.1),尼特(> = 1.6),Knitrbootstrap(> = 0.9.0),rmarkDown(> = 0.3.3),测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/lcolladotor/derfinder |
BugReports | https://github.com/lcolladotor/derfinder/issues |
取决于我 | |
进口我 | derfinderplot,,,,地区报告 |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | derfinder_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | derfinder_1.2.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | derfinder_1.2.1.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | derfinder_1.2.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/derfinder/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinder/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |