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此包是Biocumonds 3.1版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Customprodb.。

从NGS数据生成定制的蛋白质数据库，专注于RNA-SEQ数据，用于蛋白质组学搜索。

Bioconductor版本：3.1

从RNA-SEQ数据生成自定义蛋白质序列数据库进行蛋白质组学搜索

作者：萧晶王

维护者：小景王<萧静。在Vanderbilt.edu>

安装

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##尝试http：//如果不支持https：// URL源（“https://biocondudard.org/bioclite.r”）Bioclite（“customprodb”）

文件

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Browsevignettes（“CustomProdb”）

PDF.	r script.	介绍Customprodb.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	替代品那质谱那蛋白质组学那rnaseq.那SNP.那软件那转录
版本	1.8.2
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（2.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.0.1），绞喉那annotationdbi.那生物雕
进口	绞喉那Genomicranges.那RSAMTOOLS.（> = 1.10.2），基因管理那生物仪器（> = 2.26.3），基因组法（> = 1.17.13），生物雕（> = 2.17.1），stringr.那rcurl.那普利尔那VariantAnnotation.（> = 1.13.44），rtracklayer.那rsqlite.那annotationdbi.
链接到
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
加强
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	customprodb_1.8.2.tar.gz.
Windows二进制文件	customprodb_1.8.2.zip.
Mac OS x 10.6（雪豹）	customprodb_1.8.2.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	customprodb_1.8.2.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/customprodb/tree/release-3.1
包短网址	http://biocidodder.org/packages/customprodb/
包裹下载报告	下载统计信息