要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“conumee”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

conumee

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见conumee

使用Illumina 450k甲基化阵列进行增强拷贝数变异分析

Bioconductor版本:3.1

该软件包包含一套处理和绘图方法,用于使用Illumina 450k甲基化阵列执行拷贝数变化(CNV)分析。

作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka

维护者:Volker Hovestadt

引文(从R内,输入引用(“conumee”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“conumee”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“conumee”)

超文本标记语言 R脚本 conumee的小插图
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariationDNAMethylationMethylationArray微阵列归一化预处理质量控制软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.0),minfiIlluminaHumanMethylation450kmanifestIlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
进口 方法、统计数据DNAcopyrtracklayerGenomicRangesIRangesGenomeInfoDb
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownminfiDataCopyNumber450kDataRCurl
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 conumee_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 conumee_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) conumee_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) conumee_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/conumee/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/conumee/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心