要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“conumee”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见conumee.
Bioconductor版本:3.1
该软件包包含一套处理和绘图方法,用于使用Illumina 450k甲基化阵列执行拷贝数变化(CNV)分析。
作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka
维护者:Volker Hovestadt
引文(从R内,输入引用(“conumee”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“conumee”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“conumee”)
超文本标记语言 | R脚本 | conumee的小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,DNAMethylation,MethylationArray,微阵列,归一化,预处理,质量控制,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.0),minfi,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 |
进口 | 方法、统计数据DNAcopy,rtracklayer,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,minfiData,CopyNumber450kData,RCurl |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | conumee_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | conumee_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | conumee_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | conumee_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/conumee/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/conumee/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |