要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compcoder”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅compcoder。
生物导体版本:3.1
该软件包提供了广泛的功能,用于比较通过不同方法获得的结果进行RNASEQ数据的差异表达分析。它还包含用于模拟计数数据和接口到几个软件包的函数,以执行差异表达分析。
作者:夏洛特·索森(Charlotte Soneson)
维护者:夏洛特·索尼森(Charlotte Soneson)
引用(从r内,输入引用(“ compcoder”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compcoder”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ compcoder”)
R脚本 | compcoder | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,rnaseq,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(2年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.0.2),SM |
进口 | TCLTK,尼特(> = 1.2),降价,,,,rocr,,,,格子(> = 0.16),GPLOTS,,,,gtools,,,,gdata,,,,表情, 网格,克恩斯门茶,,,,大量的,,,,GGPLOT2,,,,Stringr,,,,最模式,,,,EDGER,,,,林玛,,,,vioplot, 方法 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,EBSEQ,,,,deseq,,,,deseq2(> = 1.1.31),贝塞克(> = 1.16.0),GeneFilter,,,,Noingsq,,,,TCC,,,,萨姆,,,,NBPSEQ |
系统要求 | |
增强 | rpanel,,,,DSS |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | compcoder_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | compcoder_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | compcoder_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | compcoder_1.4.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/compcoder/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compcoder/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |