要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compepitools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Compepitools。
生物导体版本:3.1
开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。
作者:http://genomics.iit.it/groups/computational-epigenomics.html
维护者:kamal kishore
引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compepitools”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ compepitools”)
R脚本 | compepitools.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.6 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机 |
进口 | AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,GGPLOT2 |
链接 | |
建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | compepitools_1.2.6.tar.gz |
Windows二进制 | compepitools_1.2.6.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | compepitools_1.2.6.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | compepitools_1.2.6.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/compepitools/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |