要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compepitools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Compepitools

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Compepitools

计算表观基因组学的工具

生物导体版本:3.1

开发了用于分析,集成和同时可视化多个样本中多个基因组区域的各种(EPI)基因组学数据类型的计算表观基因组学工具。

作者:http://genomics.iit.it/groups/computational-epigenomics.html

维护者:kamal kishore

引用(从r内,输入引用(“ Compepitools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ compepitools”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ compepitools”)

PDF R脚本 compepitools.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,基因表达,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.2.6
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 GPL
要看 r(> = 3.1.1),方法,topgo,,,,基因组机
进口 AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,rsamtools,并行,grdevices,GPLOTS,,,,iranges,,,,GenomicFeatures,,,,xvector,,,,甲基管,,,,go.db,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,GGPLOT2
链接
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,org.mm.eg.db,,,,尼特,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 compepitools_1.2.6.tar.gz
Windows二进制 compepitools_1.2.6.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) compepitools_1.2.6.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) compepitools_1.2.6.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/compepitools/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/compepitools/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心