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CN. -ops
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅CN. -ops。
CN. -MOPS- NGS数据中用于CNV检测的泊松的混合物
生物导体版本：3.1
CN. -MOPS（通过Poisson的混合使用拷贝数估计）是下一代测序（NGS）数据的拷贝数变化和畸变（CNV和CNA）的数据处理管道。该软件包提供的功能将BAM文件转换为读取计数矩阵或基因组范围对象，这些对象是CN.MOPS的输入对象。CN. -OPS在每个基因组位置上对覆盖范围的深度进行建模。因此，它不会遭受沿染色体的读数偏见。使用贝叶斯方法，CN. -MOPS分别通过其混合组件和泊松分布分解了样品的读取变化为整数拷贝数和噪声。CN. -MOPS保证FDR较低，因为错误的检测是由高噪声指示并过滤出来的。CN. -MOPS非常快，并以C ++书写。
作者：Guenter Klambauer
维护者：Guenter Klambauer
引用（从r内，输入引用（“ CN. -MOPS”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ CN. -MOPS”）
| R脚本 | CN. -MOPS：R包的手册 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 细胞生物学，，，，库务，，，，遗传学，，，，hapmap，，，，homo_sapiens，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.14.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年） |
| 执照 | LGPL（> = 2.0） |
| 要看 | r（> = 2.12），生物基因，，，，生物酶，，，，iranges，，，，基因组机 |
| 进口 | 方法，图形，rsamtools， 平行 |
| 链接 | |
| 建议 | DNACOPIGY |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/cnmops/cnmops.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | cn.mops_1.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | cn.mops_1.14.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | cn.mops_1.14.1.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | cn.mops_1.14.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/cn.mops/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cn.mops/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
