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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见cn.farms．

cn。农场-因子分析拷贝数估计

Bioconductor版本:3.1

这个包实现了cn。拷贝数变异(CNV)分析的FARMS算法。cn。FARMS允许分析最常见的Affymetrix (250K-SNP6.0)阵列类型，支持使用snow和ff进行高性能计算。

作者:Andreas Mitterecker, Djork-Arne Clevert

维护者:Andreas Mitterecker < Mitterecker at bioinf.jku.at>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cn.farms”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cn.farms”)

PDF	R脚本	cn.farms: Manual for the R package
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证	LGPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 3.0)，Biobase、方法、ff，oligoClasses，雪
进口	DBI，affxparser，益生元，DNAcopy，preprocessCore，晶格
链接
建议	pd.mapping250k.sty，pd.mapping250k.nsp，pd.genomewidesnp.5，pd.genomewidesnp.6
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	cn.farms_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	cn.farms_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	cn.farms_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	cn.farms_1.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/cn.farms/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/
软件包下载报告	下载数据