##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clonotypeR”)

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见clonotypeR．

T细胞抗原受体序列高通量分析

Bioconductor版本:3.1

T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的，产生了巨大的V， (D)和J片段的组合。重组过程中的附加过程在V和J段之间产生额外的序列多样性。总的来说，这个高度可变的区域被称为CDR3循环。该软件包的目的是处理和定量分析来自多个序列库的数百万个V-CDR3-J组合，称为克隆型。

作者:Charles Plessy < Plessy at riken.jp>

维护者:Charles Plessy < Plessy at riken.jp>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“clonotypeR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“clonotypeR”)

超文本标记语言	R脚本	clonotypeR用户指南
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	文件许可
取决于
进口	方法
链接
建议	BiocGenerics，刨边机，knitr，pvclust，RUnit，素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	clonotypeR_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	clonotypeR_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	clonotypeR_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	clonotypeR_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/clonotypeR/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clonotypeR/
软件包下载报告	下载数据