要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:
##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)
在大多数情况下，根本不需要下载包存档。
魅力
  |
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见魅力。
来自CHARM微阵列的DNA甲基化数据分析
Bioconductor版本:3.1
该软件包实现了使用Nimblegen微阵列和McrBC协议生成的DNA甲基化数据的分析工具。它发现样品之间的差异甲基化区域，计算甲基化估计百分比，并包括阵列质量评估工具。
作者:Martin Aryee, Peter Murakami, Harris Jaffee, Rafael Irizarry
维护者:Peter Murakami
引文(从R中输入引用(“魅力”)):
安装
要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:
##如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“魅力”)
| R脚本 | 魅力装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,微阵列,软件 |
| 版本 | 2.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 2.14.0),Biobase,SQN,字段,RColorBrewer,genefilter |
| 进口 | BSgenome,Biobase,益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.17.39),ff,preprocessCore、方法、统计数据Biostrings,IRanges,siggenes,nor1mix,gtools、grDevices、graphics、utils、limma平行,股东价值分析(> = 3.1.2) |
| 链接 | |
| 建议 | charmData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,corpcor |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | charmData |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 包的来源 | charm_2.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | charm_2.14.0.zip |
| Mac OS X 10.6(雪豹) | charm_2.14.0.tgz |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | charm_2.14.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/charm/tree/release-3.1 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/charm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
