安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“bsseq”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bsseq。
Bioconductor版本:3.1
酸性亚硫酸盐测序数据分析和可视化工具
作者:Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre)
维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“bsseq”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“bsseq”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“bsseq”)
R脚本 | 分析与bsseq WGBS | |
R脚本 | bsseq用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> = 2.15),方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges(> = 2.1.10),GenomicRanges(> = 1.19.6),平行,matrixStats,GenomeInfoDb |
进口 | 尺度、统计数据、图表、Biobase,locfit,gtools |
链接 | |
建议 | RUnit,bsseqData |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/kasperdanielhansen/bsseq |
取决于我 | bsseqData,DSS |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | bsseq_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | bsseq_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | bsseq_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | bsseq_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/bsseq/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bsseq/ |
包下载报告 | 下载数据 |