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此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本，请参见blima．

用于在探测器(珠)级上对Illumina微阵列进行预处理和分析的包。

Bioconductor版本:3.1

包bla包含了几种用于Illumina微阵列数据预处理的算法。着重于珠级分析，为不等长度向量的分位数归一化提供了新的方法。它提供了多种背景校正方法，包括背景减法、RMA(如卷积)和背景异常值去除。在珠级上实现了方差稳定变换。还实现了数据汇总的方法。它还提供了在检测器(珠)级和用于差异表达检测的探针级执行t检验的方法。

作者:Vojtech Kulvait

维护者:Vojtech Kulvait < Kulvait at gmail.com>

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite(" bla ")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“blima”)

PDF	R脚本	blima.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，归一化，预处理，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.0.0)
进口	beadarray(> = 2.0.0),Biobase(> = 2.0.0),BiocGenerics， grDevices，统计，图形
链接
建议	xtable，blimaTestingData，BiocStyle，illuminaHumanv4.db，光民
SystemRequirements
增强了
URL	https://bitbucket.org/kulvait/blima
全靠我
进口我
建议我	blimaTestingData
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	blima_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	blima_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	blima_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	blima_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/blima/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/blima/
软件包下载报告	下载数据