要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biomvRCNS”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见biomvRCNS.
Bioconductor版本:3.1
在这个包中,设计和实现了一个隐藏的半马尔可夫模型(HSMM)和一个同质分割模型,用于分割基因组数据,目的是帮助使用RNA-seq或tiling阵列等高通量技术进行转录本检测,并使用aCGH或测序进行拷贝数分析。
作者:杨度
维护人员:杨度
引文(从R内,输入引用(“biomvRCNS”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biomvRCNS”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biomvRCNS”)
R脚本 | biomvRCNS包介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,遗传学,微阵列,测序,软件,可视化,aCGH |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | IRanges,GenomicRanges,Gviz |
进口 | 方法,mvtnorm |
链接 | |
建议 | 集群平行,GenomicFeatures,dynamicTreeCut,Rsamtools,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | biomvRCNS_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | biomvRCNS_1.8.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | biomvRCNS_1.8.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | biomvRCNS_1.8.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/biomvRCNS/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |