要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biomvRCNS”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

biomvRCNS

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见biomvRCNS

多元生物数据拷贝数研究与分割

Bioconductor版本:3.1

在这个包中,设计和实现了一个隐藏的半马尔可夫模型(HSMM)和一个同质分割模型,用于分割基因组数据,目的是帮助使用RNA-seq或tiling阵列等高通量技术进行转录本检测,并使用aCGH或测序进行拷贝数分析。

作者:杨度

维护人员:杨度

引文(从R内,输入引用(“biomvRCNS”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biomvRCNS”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“biomvRCNS”)

PDF R脚本 biomvRCNS包介绍
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation遗传学微阵列测序软件可视化aCGH
版本 1.8.1
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 IRangesGenomicRangesGviz
进口 方法,mvtnorm
链接
建议 集群平行,GenomicFeaturesdynamicTreeCutRsamtoolsTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 biomvRCNS_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 biomvRCNS_1.8.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) biomvRCNS_1.8.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) biomvRCNS_1.8.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/biomvRCNS/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/
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文档»

Bioconductor

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支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心