要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bigmemoryExtras")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bigmemoryExtras.
Bioconductor版本:3.1
这个包定义了一个"BigMatrix" ReferenceClass,它为来自bigmemory包的filebacking .big.matrix类添加了安全和方便的特性。BigMatrix通过监控和优雅地恢复到磁盘上数据的连接来防止段错误,它还通过基于文件系统的权限系统防止意外的数据修改。我们提供了在Biobase包的eSet类族中使用bigmatrix派生类作为assayData矩阵的实用程序。BigMatrix提供了一些与带有dimnames的文件支持矩阵附加和索引相关的优化。此外,该包提供了一个“BigMatrixFactor”类,这是一个具有因子属性的文件支持矩阵。
作者:Peter M. Haverty
维护者:Peter M. Haverty在gene.com>
引用(从R中,输入引用(“bigmemoryExtras”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bigmemoryExtras")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“bigmemoryExtras”)
R脚本 | bigmemoryExtras | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.12),bigmemory(> = 4.3) |
进口 | 方法,Biobase |
链接 | |
建议 | biganalytics,BiocGenerics,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/phaverty/bigmemoryExtras |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | bigmemoryExtras_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.6(雪豹) | bigmemoryExtras_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | bigmemoryExtras_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/bigmemoryExtras/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bigmemoryExtras/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |