要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bigmemoryExtras")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

bigmemoryExtras

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bigmemoryExtras

大内存包的扩展,增加了安全性、便利性和一个因子类。

Bioconductor版本:3.1

这个包定义了一个"BigMatrix" ReferenceClass,它为来自bigmemory包的filebacking .big.matrix类添加了安全和方便的特性。BigMatrix通过监控和优雅地恢复到磁盘上数据的连接来防止段错误,它还通过基于文件系统的权限系统防止意外的数据修改。我们提供了在Biobase包的eSet类族中使用bigmatrix派生类作为assayData矩阵的实用程序。BigMatrix提供了一些与带有dimnames的文件支持矩阵附加和索引相关的优化。此外,该包提供了一个“BigMatrixFactor”类,这是一个具有因子属性的文件支持矩阵。

作者:Peter M. Haverty

维护者:Peter M. Haverty在gene.com>

引用(从R中,输入引用(“bigmemoryExtras”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("bigmemoryExtras")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“bigmemoryExtras”)

PDF R脚本 bigmemoryExtras
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation基础设施软件
版本 1.12.0
在Bioconductor公司 BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.12),bigmemory(> = 4.3)
进口 方法,Biobase
链接
建议 biganalyticsBiocGenericsRUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/phaverty/bigmemoryExtras
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 bigmemoryExtras_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6(雪豹) bigmemoryExtras_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) bigmemoryExtras_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/bigmemoryExtras/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bigmemoryExtras/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心