安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“beadarray”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

beadarray

这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beadarray

质量评估和低级Illumina公司BeadArray数据分析

Bioconductor版本:3.1

包能够读取bead-level数据(生口角和文本文件)输出BeadScan以及从BeadStudio bead-summary数据。质量评估方法和低层次的分析。

作者:马克·邓宁迈克史密斯,乔纳森•凯恩斯安迪•林奇马特里奇

维护人员:马克邓宁<马克。邓宁在cruk.cam.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“beadarray”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“beadarray”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“beadarray”)

PDF R脚本 beadarray.pdf
PDF R脚本 beadlevel.pdf
PDF R脚本 beadsummary.pdf
PDF R脚本 ImageProcessing.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件
版本 2.18.0
Bioconductor自 BioC 1.8 (r - 2.3)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.13.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8)、方法ggplot2
进口 BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,reshape2,GenomicRanges,IRanges,illuminaio
链接
建议 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db,gridExtra,BiocStyle,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,ggbio,Nozzle.R1,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 beadarrayExampleData
进口我 arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases,blima,epigenomix
建议我 beadarraySNP,blimaTestingData,光民
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 beadarray_2.18.0.tar.gz
Windows二进制 beadarray_2.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) beadarray_2.18.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) beadarray_2.18.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/beadarray/tree/release - 3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心