要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ballgown")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

舞会礼服

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见舞会礼服

灵活的,异构体水平的差异表达分析

Bioconductor版本:3.1

用于组合转录组的统计分析工具,包括灵活的差异表达分析,转录本结构的可视化,以及组合转录本与注释的匹配。

作者:Alyssa C. Frazee [aut, cre], Leonardo Collado-Torres [aut], Andrew E. Jaffe [aut], Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护人员:Alyssa Frazee < Alyssa . Frazee at gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“舞会礼服”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ballgown")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“舞会礼服”)

超文本标记语言 R脚本 Ballgown灵活的异构体水平差异表达分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression预处理RNASeq软件StatisticalMethod
版本 2.0.0
在Bioconductor公司 BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.1.1),方法
进口 GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.1.2),RColorBrewer样条函数,股东价值分析limmartracklayer(> = 1.25.13),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议 testthatknitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
全靠我
进口我
建议我 聚酯
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 ballgown_2.0.0.tar.gz
Windows二进制 ballgown_2.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) ballgown_2.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) ballgown_2.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ballgown/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心