要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ballgown")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见舞会礼服.
Bioconductor版本:3.1
用于组合转录组的统计分析工具,包括灵活的差异表达分析,转录本结构的可视化,以及组合转录本与注释的匹配。
作者:Alyssa C. Frazee [aut, cre], Leonardo Collado-Torres [aut], Andrew E. Jaffe [aut], Jeffrey T. Leek [aut, ths]
维护人员:Alyssa Frazee < Alyssa . Frazee at gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“舞会礼服”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("ballgown")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“舞会礼服”)
超文本标记语言 | R脚本 | Ballgown灵活的异构体水平差异表达分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,预处理,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 2.0.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.1.1),方法 |
进口 | GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.1.2),RColorBrewer样条函数,股东价值分析,limma,rtracklayer(> = 1.25.13),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | testthat,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 聚酯 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | ballgown_2.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | ballgown_2.0.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | ballgown_2.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | ballgown_2.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ballgown/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |