要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ampliQueso”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ampliQueso

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见ampliQueso

扩增子富集板分析

Bioconductor版本:3.1

该软件包提供了分析扩增子测序面板的工具和报告,如AmpliSeq

作者:Alicja Szabelska < Alicja。Szabelska在up.poznan.pl>;Marek Wiewiorka < Marek。Wiewiorka在gmail.com>;Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>

维护者:Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“ampliQueso”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ampliQueso”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ampliQueso”)

PDF R脚本 ampliQueso底漆
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionRNASeqReportWriting测序软件转录可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.15.0),rnaSeqMap(> = 2.17.1),knitrrglggplot2gplots平行,doParallelforeachVariantAnnotationgenefilterstatmodxtable
进口 刨边机DESeqsamr
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ampliQueso_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 ampliQueso_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ampliQueso_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) ampliQueso_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ampliQueso/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ampliQueso/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心