要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ampliQueso”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见ampliQueso.
Bioconductor版本:3.1
该软件包提供了分析扩增子测序面板的工具和报告,如AmpliSeq
作者:Alicja Szabelska < Alicja。Szabelska在up.poznan.pl>;Marek Wiewiorka < Marek。Wiewiorka在gmail.com>;Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>
维护者:Michal Okoniewski < Michal at fgcz.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“ampliQueso”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ampliQueso”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ampliQueso”)
R脚本 | ampliQueso底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,RNASeq,ReportWriting,测序,软件,转录,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.15.0),rnaSeqMap(> = 2.17.1),knitr,rgl,ggplot2,gplots平行,doParallel,foreach,VariantAnnotation,genefilter,statmod,xtable |
进口 | 刨边机,DESeq,samr |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ampliQueso_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ampliQueso_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ampliQueso_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ampliQueso_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ampliQueso/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ampliQueso/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |