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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅变体滤波器。

过滤编码和非编码遗传变体

生物导体版本：3.1

使用不同的标准，例如遗传模型，氨基酸变化后果，人群中的最小等位基因频率，剪接部位的强度，保护等，滤波器遗传变异变异。

作者：Robert Castelo [AUT，CRE]，Dei Martinez Elurbe [CTB]，Pau Puigdevall [CTB]

维护者：Robert Castelo

安装

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文档

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browsevignettes（“ variantFiltering”）

PDF		变体滤波器：滤波器编码和非编码遗传变体
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，遗传学，，，，高通量序列，，，，homo_sapiens，，，，SNP，，，，测序，，，，软件
版本	1.4.3
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（2年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.0.0），方法，生物基因（> = 0.13.8），变体（> = 1.13.29）
进口	DBI，，，，rsqlite（> = 1.0.0），生物酶，，，，S4VECTORS，，，，iranges（> = 2.1.18），rbgl，，，，图形，，，，AnnotationDbi，，，，生物比较，，，，生物弦（> = 2.33.11），GenomeInfodB（> = 1.3.6），基因组机（> = 1.19.13），GenomicFeatures，，，，rsamtools（> = 1.17.8），BSGENOME，，，，GVIZ，，，，闪亮的
链接	S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦
建议	生物使用，，，，org.hs.eg.db，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608，，，，mafdb.all.wgs.phase1.release.v3.20101123，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137，，，，mafdb.exac.r0.3.sites，，，，phastcons100way.ucsc.hg19，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，sift.hsapiens.dbsnp137
系统要求
增强
URL	https://github.com/rcastelo/variantfiltering/issues
取决于我	mafdb.all.wgs.phase1.release.v3.20101123，，，，mafdb.all.wgs.phase3.release.v5a.20130502，，，，mafdb.esp6500si.v2.ssa137，，，，mafdb.exac.r0.3.sites，，，，phastcons100way.ucsc.hg19，，，，phastcons7way.ucsc.hg38
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	variantFiltering_1.4.3.tar.gz
Windows二进制	variantFiltering_1.4.3.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	variantFiltering_1.4.3.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	variantFiltering_1.4.3.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/variantfiltering/tree/release-3.1
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/variantfiltering/
软件包下载报告	下载统计