要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TSSi”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见TSSi.
Bioconductor版本:3.1
在高通量测序数据中识别并规范化转录起始位点。
作者:Julian Gehring, Clemens Kreutz
维护者:Julian Gehring < Julian。Gehring at embl.de>
引文(从R内,输入引用(“TSSi”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TSSi”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TSSi”)
R脚本 | TSSi包简介:转录起始位点的鉴定 | |
参考手册 |
biocViews | 遗传学,预处理,RNASeq,测序,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.13.2) |
进口 | 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),S4Vectors,Hmisc,minqa统计数据,Biobase(> = 0.3.2),plyr,IRanges |
链接 | |
建议 | rtracklayer |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行 |
URL | http://julian-gehring.github.com/TSSi/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | TSSi_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | TSSi_1.14.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | TSSi_1.14.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | TSSi_1.14.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/TSSi/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TSSi/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |