要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

SeqArray

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见SeqArray

全基因组测序变异的大数据管理

Bioconductor版本:3.1

使用CoreArray c++库对全基因组变异进行大数据管理:基因型数据和注释以面向数组的方式存储,使用R编程语言提供对遗传变异的高效访问。

作者:郑秀文[aut, cre], Stephanie Gogarten [aut], Cathy Laurie [ctb]

维护者:郑秀文

引文(从R内,输入引用(“SeqArray”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SeqArray”)

PDF R脚本 SeqArray教程
PDF SeqArray-JSM2013.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 遗传学基础设施测序软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 gdsfmt(> = 1.2.2)
进口 方法,BiostringsGenomicRangesIRangesS4VectorsVariantAnnotation
链接 gdsfmt
建议 平行,BiocStyleBiocGenericsknitrRUnitRcpp
SystemRequirements
增强了
URL http://corearray.sourceforge.net/tutorials/SeqArray/http://github.com/zhengxwen/SeqArray
BugReports http://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues
全靠我 SeqVarTools
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 SeqArray_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 SeqArray_1.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) SeqArray_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) SeqArray_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SeqArray/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心