要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见SeqArray.
Bioconductor版本:3.1
使用CoreArray c++库对全基因组变异进行大数据管理:基因型数据和注释以面向数组的方式存储,使用R编程语言提供对遗传变异的高效访问。
作者:郑秀文[aut, cre], Stephanie Gogarten [aut], Cathy Laurie [ctb]
维护者:郑秀文
引文(从R内,输入引用(“SeqArray”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SeqArray”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SeqArray”)
R脚本 | SeqArray教程 | |
SeqArray-JSM2013.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 遗传学,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | gdsfmt(> = 1.2.2) |
进口 | 方法,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,VariantAnnotation |
链接 | gdsfmt |
建议 | 平行,BiocStyle,BiocGenerics,knitr,RUnit,Rcpp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://corearray.sourceforge.net/tutorials/SeqArray/http://github.com/zhengxwen/SeqArray |
BugReports | http://github.com/zhengxwen/SeqArray/issues |
全靠我 | SeqVarTools |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | SeqArray_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | SeqArray_1.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | SeqArray_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | SeqArray_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/SeqArray/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SeqArray/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |