安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Rqc”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rqc。
Bioconductor版本:3.1
Rqc是一个优化工具用于高通量测序数据的质量控制和评估。它执行并行处理整个文件并生成一个报告,包含一组高分辨率图形。
作者:Welliton Souza, Benilton卡瓦略< beniltoncarvalho gmail.com >
维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“Rqc”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Rqc”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Rqc”)
HTML | R脚本 | Rqc -高通量测序数据的质量控制工具 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,质量控制,测序,软件 |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | BiocParallel,ShortRead,ggplot2 |
进口 | BiocGenerics,Biostrings,IRanges、方法、S4Vectors,knitr(> = 1.7),BiocStyle,plyr,减价、网格reshape2 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/labbcb/Rqc |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | Rqc_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | Rqc_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Rqc_1.2.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | Rqc_1.2.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/rqc/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rqc/ |
包下载报告 | 下载数据 |