要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见RpsiXML.
Bioconductor版本:3.1
查询、数据结构和交互数据集可视化的接口。这个包实现了PSI-MI 2.5标准,目前支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断增加。
作者:Jitao David Zhang, Stefan Wiemann, Marc Carlson, Tony Chiang撰稿
维护者:Jitao David Zhang
引文(从R内,输入引用(“RpsiXML”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RpsiXML”)
R脚本 | RpsiXML包的应用实例 | |
R脚本 | 读取PSI-25 XML文件 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,蛋白质组学,软件 |
版本 | 2.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | 方法,注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi |
进口 | |
链接 | |
建议 | org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats,ScISI |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com |
全靠我 | ScISI |
进口我 | ScISI |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RpsiXML_2.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | RpsiXML_2.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RpsiXML_2.10.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RpsiXML_2.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RpsiXML/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |