要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RpsiXML

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见RpsiXML

R接口到PSI-MI 2.5文件

Bioconductor版本:3.1

查询、数据结构和交互数据集可视化的接口。这个包实现了PSI-MI 2.5标准,目前支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断增加。

作者:Jitao David Zhang, Stefan Wiemann, Marc Carlson, Tony Chiang撰稿

维护者:Jitao David Zhang

引文(从R内,输入引用(“RpsiXML”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RpsiXML”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RpsiXML”)

PDF R脚本 RpsiXML包的应用实例
PDF R脚本 读取PSI-25 XML文件
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施蛋白质组学软件
版本 2.10.0
在Bioconductor BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 方法,注释(> = 1.21.0),(> = 1.21.0),BiobaseRBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
链接
建议 org.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dborg.Dm.eg.dborg.Rn.eg.dborg.Sc.sgd.dbhom.Hs.inp.dbhom.Mm.inp.dbhom.Dm.inp.dbhom.Rn.inp.dbhom.Sc.inp.dbRgraphvizppiStatsScISI
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com
全靠我 ScISI
进口我 ScISI
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RpsiXML_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 RpsiXML_2.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RpsiXML_2.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RpsiXML_2.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RpsiXML/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心