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此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见Roleswitch。

利用单个样本的配对表达数据推断miRNA-mRNA相互作用

Bioconductor版本:3.1

使用来自单个样本的配对表达数据推断MiRNA-mRNA相互作用签名(ProMISe)的概率。Roleswitch通过推断mRNA (miRNA)成为miRNA (mRNA)的靶标(“靶标”)的概率来运作，考虑到所有mRNA (miRNA)的表达由于它们对同一miRNA (mRNA)的潜在竞争。由于细胞内动态miRNA的抑制，Roleswitch假设总转录mRNA水平高于观察到的(平衡)mRNA水平，并基于上述推断迭代更新每个mRNA靶点的总转录。注:在本文中，我们使用ProMISe作为模型名和推断的分数名。

作者:李曰

维护者:Yue Li

安装

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文档

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PDF	R脚本	Roleswitch
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件,microrna的
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),pracma,重塑,plotrix,微,biomaRt,Biostrings,Biobase,DBI
进口
链接
建议	ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/roleswitch.html
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	Roleswitch_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	Roleswitch_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	Roleswitch_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	Roleswitch_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Roleswitch/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Roleswitch/
包下载报告	下载数据