要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Risa”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见Risa.
Bioconductor版本:3.1
以制表符分隔的调查/研究/化验(ISA)格式是一种通用框架,用于收集和交流复杂的元数据(即样本特征、使用的技术、所做的测量类型),这些元数据来自使用从传统方法到高通量技术的技术组合的实验。Risa允许以ISA-Tab格式访问元数据/数据,并构建Bioconductor数据结构。目前,支持来自微阵列、流式细胞仪和代谢组学(即质谱)分析的数据。该软件包是可扩展的,正在努力支持与蛋白质组学分析相关的元数据。
作者:Alejandra Gonzalez-Beltran, Audrey Kauffmann, Steffen Neumann, Gabriella Rustici, ISA团队
维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran, ISA团队
引文(从R内,输入引用(Risa)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Risa”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (Risa)
R脚本 | Risa:将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,DataImport,MassSpectrometry,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R (>= 2.0.9),Biobase(>= 2.4.0),Rcpp(> = 0.9.13),biocViews,affy |
进口 | xcms |
链接 | |
建议 | faahKO(> = 1.2.11) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL |
|
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | Risa_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | Risa_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Risa_1.10.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | Risa_1.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/Risa/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Risa/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |