要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Risa”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Risa

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见Risa

将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:3.1

以制表符分隔的调查/研究/化验(ISA)格式是一种通用框架,用于收集和交流复杂的元数据(即样本特征、使用的技术、所做的测量类型),这些元数据来自使用从传统方法到高通量技术的技术组合的实验。Risa允许以ISA-Tab格式访问元数据/数据,并构建Bioconductor数据结构。目前,支持来自微阵列、流式细胞仪和代谢组学(即质谱)分析的数据。该软件包是可扩展的,正在努力支持与蛋白质组学分析相关的元数据。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran, Audrey Kauffmann, Steffen Neumann, Gabriella Rustici, ISA团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran, ISA团队

引文(从R内,输入引用(Risa)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Risa”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (Risa)

PDF R脚本 Risa:将实验元数据从ISA-tab转换为Bioconductor数据结构
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释DataImportMassSpectrometry软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (>= 2.0.9),Biobase(>= 2.4.0),Rcpp(> = 0.9.13),biocViewsaffy
进口 xcms
链接
建议 faahKO(> = 1.2.11)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 Risa_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 Risa_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) Risa_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) Risa_1.10.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Risa/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Risa/
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