要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Ringo”)
在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
林格
  |
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见林格．
芯片-芯片寡聚阵列的研究
Bioconductor版本:3.1
软件包Ringo有助于对ChIP-chip数据进行初步分析。该软件包的主要功能是数据读取，质量评估，数据可视化和识别显示富集在ChIP-chip的基因组区域。该包具有处理用于ChIP-chip项目的NimbleGen的双色寡核苷酸微阵列的功能，但也包含更多用于ChIP-chip数据分析的通用函数，因为数据是作为RGList(原始)或ExpressionSet(预处理)提供的。该包采用了来自Bioconductor项目的各种其他包的功能，并提供了额外的特定于chip- chip和特定于nimblegen的功能。
作者:Joern Toedling, Oleg Sklyar, Tammo Krueger, Matt Ritchie, Wolfgang Huber
维护者:J. Toedling
引文(从R内，输入引用(“林格”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Ringo”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“林格”)
| R脚本 | R NimbleGen寡聚阵列的研究 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DataImport，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(9年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法,Biobase(> = 1.14.1),RColorBrewer，limma，矩阵、网格晶格 |
| 进口 | BiocGenerics(> = 0.1.11),genefilter，limma，vsn, stats4 |
| 链接 | |
| 建议 | rtracklayer(> = 1.3.1),mclust，topGO(> = 1.15.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | ccTutorial，SimBindProfiles，斯塔尔 |
| 进口我 | Repitools |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | Ringo_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Ringo_1.32.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Ringo_1.32.0.tgz |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | Ringo_1.32.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/Ringo/tree/release-3.1 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Ringo/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
