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repitools
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅repitools。
表观基因组工具
生物导体版本：3.1
用于分析基于富集的表观基因组数据的工具。特征包括根据基因表达环境对启动子的摘要和可视化，发现差异甲基化/结合的区域，用于量化甲基化等。
作者：马克·罗宾逊（Mark Robinson）<马克·罗宾森（Mark.robinson）在imls.uzh.ch.ch>，dario strbenac
维护者：马克·罗宾逊（Mark Robinson）<马克·罗宾森（Mark.robinson）
引用（从r内，输入引用（“ repitools”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Repitools”）
| R脚本 | 使用重新通信进行表观基因组测序数据 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | DNAMETHYLATY，，，，基因表达，，，，甲基，，，，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年） |
| 执照 | LGPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.0.0），方法，生物基因（> = 0.8.0） |
| 进口 | S4VECTORS，，，，iranges（> = 1.20.0），GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，基因组签名，，，，BSGENOME，，，，GPLOTS， 网格，大量的，，，，gsmoothr，，，，EDGER（> = 3.4.0），DNACOPIGY，，，，林戈，，，，香气，，，，rsolnp， 平行，生物弦，，，，rsamtools，，，，簇，，，，rtracklayer |
| 链接 | |
| 建议 | Shortread，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | repitools_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | repitools_1.14.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | repitools_1.14.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | repitools_1.14.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/repitools/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/repitools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
