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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Rcade。

R-based ChIP-seq和微分表达式的分析——基于一个集成的工具点ChIP-seq汇总数据分析与微分表达式。

Bioconductor版本:3.1

Rcade(代表“R-based ChIP-seq和微分表达式的分析”)是一个集成的工具与微分表达式ChIP-seq数据汇总数据,通过贝叶斯框架。鉴别的关键应用程序感兴趣的基因转录因子的目标——也就是说,我们收集相关基因ChIP-seq峰,和微分表达式在某些扰动相关的特遣部队。

作者:乔纳森·凯恩斯

维护人员:乔纳森·凯恩斯< jmcairns200 gmail.com >

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PDF	R脚本	Rcade装饰图案
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,测序,软件,转录
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 2.14.0)、方法GenomicRanges,baySeq,Rsamtools
进口	图形,S4Vectors,rgl,plotrix
链接
建议	limma,biomaRt,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	Rcade_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	Rcade_1.10.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	Rcade_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	Rcade_1.10.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/rcade/tree/release - 3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Rcade/
包下载报告	下载数据