要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rninteract”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAinteract.
Bioconductor版本:3.1
rninteraction通过从图像中提取的特征等多维读出来估计遗传相互作用。筛管假定采用多孔板或类似设计。从每个孔的特征列表(例如细胞数量、面积、荧光强度)开始,估计遗传相互作用。该软件包提供了报告相互作用基因对、绘制热图和双RNAi图的功能。可以为质量控制和分析编写HTML报告。
作者:Bernd Fischer
维护者:Bernd Fischer
引文(从R内,输入引用(“RNAinteract”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rninteract”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RNAinteract”)
R脚本 | RNAinteract | |
参考手册 |
biocViews | CellBasedAssays,预处理,质量控制,软件,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.12.0),abind,locfit,Biobase |
进口 | RColorBrewer,ICS,ICSNP,cellHTS2,geneplotter,gplots、网格hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、splots(> = 1.13.12) |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | RNAinteractMAPK |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RNAinteract_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | RNAinteract_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RNAinteract_1.16.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | RNAinteract_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RNAinteract/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |