要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rninteract”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RNAinteract

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAinteract

从多维特征估计成对相互作用

Bioconductor版本:3.1

rninteraction通过从图像中提取的特征等多维读出来估计遗传相互作用。筛管假定采用多孔板或类似设计。从每个孔的特征列表(例如细胞数量、面积、荧光强度)开始,估计遗传相互作用。该软件包提供了报告相互作用基因对、绘制热图和双RNAi图的功能。可以为质量控制和分析编写HTML报告。

作者:Bernd Fischer

维护者:Bernd Fischer

引文(从R内,输入引用(“RNAinteract”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rninteract”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAinteract”)

PDF R脚本 RNAinteract
PDF 参考手册

细节

biocViews CellBasedAssays预处理质量控制软件可视化
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.12.0),abindlocfitBiobase
进口 RColorBrewerICSICSNPcellHTS2geneplottergplots、网格hwriter晶格latticeExtralimma、方法、splots(> = 1.13.12)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 RNAinteractMAPK
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RNAinteract_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 RNAinteract_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RNAinteract_1.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) RNAinteract_1.16.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RNAinteract/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心