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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见RIPSeeker．

RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包

Bioconductor版本:3.1

利用负二项发射概率的两态HMM从RIP-seq对准中推断和区分RIP峰值。虽然RIPSeeker是专门为RIP-seq数据分析量身定制的，但它还提供了一套生物信息学工具，集成在这个独立的软件包中，全面解决了从对齐后处理到可视化和注释等问题。

作者:李越

维护者:Yue Li

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RIPSeeker”)

文档

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browseVignettes(“RIPSeeker”)

PDF	R脚本	RIPSeeker:用于从RIP-seq实验中识别蛋白质相关转录本的统计包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	RIPSeq，测序，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.15)，方法，IRanges，GenomicRanges，Rsamtools，GenomicAlignments，rtracklayer
进口
链接
建议	biomaRt，ChIPpeakAnno平行,GenomicFeatures
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我	RIPSeekerData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	RIPSeeker_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	RIPSeeker_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	RIPSeeker_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	RIPSeeker_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/RIPSeeker/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RIPSeeker/
软件包下载报告	下载数据