安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“R3CPET”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅R3CPET。
Bioconductor版本:3.1
包提供了一组方法来推断的蛋白质更可能共同维护chormatin交互ChIA-PET实验结果。
作者:杨m . n . Djekidel陈等。
维护人员:穆罕默德Nadhir Djekidel < djek。nad gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“R3CPET”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“R3CPET”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“R3CPET”)
R脚本 | 3 cpet:找到辅助因子复合物保持Chia-PET交互 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 贝叶斯,GeneExpression,GenePrediction,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,软件 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(1年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.2),Rcpp(> = 0.10.4)方法 |
进口 | 平行,线索,ggplot2,pheatmap,IRanges,clValid,igraph,data.table,GenomicRanges,S4Vectors,DAVIDQuery,ggbio,reshape2,Hmisc |
链接 | Rcpp |
建议 | BiocStyle,knitr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,biovizBase,biomaRt,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | R3CPET_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | R3CPET_1.0.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | R3CPET_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | R3CPET_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/r3cpet/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/R3CPET/ |
包下载报告 | 下载数据 |