要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Pbase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Pbase

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见Pbase

操作和探索蛋白质和蛋白质组学数据

Bioconductor版本:3.1

在蛋白质组学实验中用于研究和理解蛋白质序列数据的一组类和函数。

作者:Laurent Gatto [aut], Sebastian Gibb [aut, cre]

维护者:Sebastian Gibb , Laurent Gatto

引文(从R内,输入引用(“Pbase”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Pbase”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Pbase”)

超文本标记语言 R脚本 集成和UCSC映射
超文本标记语言 R脚本 映射
超文本标记语言 R脚本 Pbase-data
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDataRepresentation基础设施MassSpectrometry蛋白质组学软件可视化
版本 0.8.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.10),方法,BiocGenericsRcppGviz
进口 切肉刀(> = 1.3.6),BiobaseBiostringsIRangesS4VectorsmzIDmzR(> = 1.99.1),MSnbase(> = 1.15.5),PvizbiomaRtGenomicRangesrtracklayer
链接
建议 testthat(> = 0.8),ggplot2BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneAnnotationHubknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase
BugReports https://github.com/ComputationalProteomicsUnit/Pbase/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 Pbase_0.8.0.tar.gz
Windows二进制 Pbase_0.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) Pbase_0.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) Pbase_0.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Pbase/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Pbase/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心