要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pathnet”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅路径网。
生物导体版本:3.1
路径网使用基因的途径和差异表达水平(从微阵列实验获得)来识别1)显着富集和2)在差异表达的背景下相互关联的途径。该算法在:PathNet:使用拓扑信息进行途径分析的工具中描述。Dutta B,Wallqvist A和Reifman J.生物学和医学的源代码2012年9月24日; 7(1):10。
作者:bhaskar dutta
维护者:Jason B. Smith
引用(从r内,输入引用(“路径网”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ pathnet”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ pathnet”)
R脚本 | 路径网 | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,kegg,,,,多重组合,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(3年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 1.14.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | Pathnetdata,,,,运行,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 富集兄弟 |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | pathnet_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | PATHNET_1.8.0.ZIP |
Mac OS X 10.6(雪豹) | pathnet_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | pathnet_1.8.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/pathnet/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pathnet/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |