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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅NetPathminer。

NetPathminer用于生物网络建设，路径挖掘和可视化

生物导体版本：3.1

NetPathminer是使用基因组规模网络进行网络路径挖掘的一般框架。它从KGML，SBML和Biopax文件构建网络，提供三个网络表示，代谢，反应和基因表示。NetPathminer找到了活动路径并应用机器学习方法来总结发现的路径以简化解释。它还提供了网络和途径的静态和交互式可视化，以帮助手动调查。

作者：艾哈迈德·穆罕默德（Ahmed Mohamed）<穆罕默德（kuicr.kyoto-u.ac.jp>），蒂姆·汉考克（Tim Hancock>，尼古拉斯·威克（Nicolas Wicker）<尼古拉斯（Nicolas）。

维护者：艾哈迈德·穆罕默德（Ahmed Mohamed

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// URL（“ https：//www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ netpathpathminer”）

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ NetPathminer”）

PDF	R脚本	NetPathminer小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	分类，，，，聚类，，，，GraphandNetwork，，，，网络，，，，途径，，，，软件
版本	1.4.1
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（2年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.0.2），Igraph（> = 1.0）
进口
链接
建议	rbiopaxparser（> = 2.1），rcurl，，，，rcytoscape，，，，图形
系统要求	libxml2，libsbml（> = 5.5）
增强
URL	https://github.com/ahmohamed/netpathminer
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	NetPathminer_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	NetPathminer_1.4.1.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	NetPathminer_1.4.1.tgz
Mac OS X 10.9（Mavericks）	NetPathminer_1.4.1.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/netpathminer/tree/release-3.1
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/netpathminer/
软件包下载报告	下载统计