要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“NCIgraph”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见NCIgraph.
Bioconductor版本:3.1
提供各种方法来在R图对象中从NCI路径数据库加载路径并重新格式化它们。
作者:劳伦特·雅各布
维护者:Laurent Jacob < Laurent。雅各布在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“NCIgraph”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“NCIgraph”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“NCIgraph”)
R脚本 | NCIgraph:来自NCI路径集成数据库的网络作为graphNEL对象。 | |
参考手册 |
biocViews | GraphAndNetwork,通路,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | 图, r (>= 2.10.0) |
进口 | 图,KEGGgraph、方法、RBGL,RCytoscape,R.methodsS3 |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | DEGraph |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | DEGraph |
建议我 | DEGraph |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | NCIgraph_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | NCIgraph_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | NCIgraph_1.16.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | NCIgraph_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/NCIgraph/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NCIgraph/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |