要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“甲基Seekr”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

甲基赛克

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基赛克

BIS-SEQ数据的分割

生物导体版本:3.1

这是从BIS-SEQ数据发现监管区域的软件包

作者:Lukas Burger,Dimos Gaidatzis,Dirk Schubeler和Michael Stadler

维护者:lukas Burger

引用(从r内,输入引用(“甲基甲基”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“甲基Seekr”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“甲基赛克”)

PDF R脚本 甲基赛克
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,甲基,,,,测序,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 GPL(> = 2)
要看 rtracklayer(> = 1.16.3),并行(> = 2.15.1),MHSMM(> = 0.4.4)
进口 iranges(> = 1.16.3),BSGENOME(> = 1.26.1),基因组机(> = 1.10.5),Geneplotter(> = 1.34.0),图形(> = 2.15.2),grdevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),stats(> = 2.15.2),utils(> = 2.15。2)
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 甲基管
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 甲基Seekr_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 甲基Seekr_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) 甲基Seekr_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) 甲基Seekr_1.8.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/methylseekr/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methylseekr/
软件包下载报告 下载统计

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生物导体

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