安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MergeMaid”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MergeMaid。
Bioconductor版本:3.1
这个R的功能扩展的目的是cross-study比较基因表达数据数组。需要从用户是基因表达矩阵,相应gene-id向量和其他有用的信息,他们可以“列表”,“矩阵”,或“ExpressionSet”。主要功能是将输入对象转换为“mergeExprs”数据在合并后的格式,这样常见的基因在不同的数据集可以很容易地找到。和“intcor”计算相关系数的函数。其他功能使用的输出“modelOutcome”图形显示结果和旨在协会与生存的基因表达数据。
作者:于宁波中钟< ams.jhu.edu > Leslie应付<应付jhu.edu >伊丽莎白·加勒特< esg jhu.edu > Giovanni Parmigiani < gp jhu.edu >
维护人员:于宁波中钟< ams.jhu.edu >
从内部引用(R,回车引用(“MergeMaid”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MergeMaid”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MergeMaid”)
R脚本 | MergeMaid底漆 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 2.40.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.10.0),生存,Biobase,质量、方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://astor.som.jhmi.edu/MergeMaid |
取决于我 | |
进口我 | metaArray,XDE |
建议我 | oneChannelGUI |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | MergeMaid_2.40.0.tar.gz |
Windows二进制 | MergeMaid_2.40.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MergeMaid_2.40.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | MergeMaid_2.40.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/mergemaid/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MergeMaid/ |
包下载报告 | 下载数据 |