安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MSnbase”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSnbase。
Bioconductor版本:3.1
基本绘图、数据操纵和MS-based蛋白质组学数据的处理。
作者:洛朗与< lg390 cam.ac。英国的贡献> Guangchuang Yu Samuel Wieczorek Vasile-Cosmin Lazar,弗拉季斯拉夫•Petyuk,托马斯Naake和塞巴斯蒂安·吉布。
维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“MSnbase”)
):
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MSnbase”)
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browseVignettes (“MSnbase”)
R脚本 | 基函数和类MS-based蛋白质组学 | |
R脚本 | MSnbase发展 | |
R脚本 | MSnbase IO功能 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.16.2 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> = 3.1),方法,BiocGenerics(> =是0.7.1),Biobase(> = 2.15.2),mzR,BiocParallel,ProtGenerics |
进口 | plyr,IRanges,preprocessCore,vsn、网格reshape2stats4,affy,嫁祸于,pcaMethods,mzID(> = 1.5.2),MALDIquant(> = 1.12.0),消化,晶格,ggplot2,S4Vectors,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,动物园,knitr(> = 1.1.0),的方式,Rdisop,pRoloc,pRolocdata(> = 1.0.7),msdata,roxygen2,rgl,BiocStyle,imputeLCMD,规范,gplots |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/lgatto/MSnbase/issues |
取决于我 | msmsEDA,msmsTests,MSstats,ProCoNA,pRoloc,pRolocdata,pRolocGUI,proteoQC,RforProteomics,synapter |
进口我 | MSnID,Pbase |
建议我 | BiocGenerics,等压线,qcmetrics,rpx |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | MSnbase_1.16.2.tar.gz |
Windows二进制 | MSnbase_1.16.2.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MSnbase_1.16.2.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | MSnbase_1.16.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/msnbase/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MSnbase/ |
包下载报告 | 下载数据 |