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MSnbase

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基函数和类MS-based蛋白质组学

Bioconductor版本:3.1

基本绘图、数据操纵和MS-based蛋白质组学数据的处理。

作者:洛朗与< lg390 cam.ac。英国的贡献> Guangchuang Yu Samuel Wieczorek Vasile-Cosmin Lazar,弗拉季斯拉夫•Petyuk,托马斯Naake和塞巴斯蒂安·吉布。

维修工:Laurent与< lg390在cam.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“MSnbase”)):

安装

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PDF R脚本 基函数和类MS-based蛋白质组学
PDF R脚本 MSnbase发展
PDF R脚本 MSnbase IO功能
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,基础设施,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件
版本 1.16.2
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 3.1),方法,BiocGenerics(> =是0.7.1),Biobase(> = 2.15.2),mzR,BiocParallel,ProtGenerics
进口 plyr,IRanges,preprocessCore,vsn、网格reshape2stats4,affy,嫁祸于,pcaMethods,mzID(> = 1.5.2),MALDIquant(> = 1.12.0),消化,晶格,ggplot2,S4Vectors,Rcpp
链接 Rcpp
建议 testthat,动物园,knitr(> = 1.1.0),的方式,Rdisop,pRoloc,pRolocdata(> = 1.0.7),msdata,roxygen2,rgl,BiocStyle,imputeLCMD,规范,gplots
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/lgatto/MSnbase/issues
取决于我 msmsEDA,msmsTests,MSstats,ProCoNA,pRoloc,pRolocdata,pRolocGUI,proteoQC,RforProteomics,synapter
进口我 MSnID,Pbase
建议我 BiocGenerics,等压线,qcmetrics,rpx
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 MSnbase_1.16.2.tar.gz
Windows二进制 MSnbase_1.16.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MSnbase_1.16.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛) MSnbase_1.16.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/msnbase/tree/release - 3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSnbase/
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支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心