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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见InPAS．

新型多聚腺苷酸化位点(PAS)的鉴定

Bioconductor版本:3.1

选择性聚腺苷酸化(APA)是一种重要的转录后调控机制，在大多数人类基因中都有发生。InPAS有助于从RNAseq数据中发现新的APA位点。它利用cleanUpdTSeq对确定的APA位点进行微调。

作者:欧建宏、朴成美、Michael R. Green、朱丽华

维护者:欧建宏<建宏。你在umassmed。edu>

安装

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文档

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browseVignettes(“InPAS”)

PDF	R脚本	InPAS装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，报道，DifferentialSplicing，GeneRegulation，RNASeq，测序，软件，转录
版本	1.0.6
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.1)，GenomicRanges，GenomicFeatures，BiocParallel，S4Vectors
进口	AnnotationDbi，BSgenome，cleanUpdTSeq，Gviz，seqinr，limma，IRanges，GenomeInfoDb
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene，rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	InPAS_1.0.6.tar.gz
Windows二进制	InPAS_1.0.6.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	InPAS_1.0.6.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	InPAS_1.0.6.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/InPAS/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/InPAS/
软件包下载报告	下载数据