##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“IRanges”)

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见IRanges。

用于操纵序列间隔的基础设施

Bioconductor版本:3.1

该软件包提供有效的低级和高度可重复使用的S4类，用于存储整数的范围，RLE向量（运行长度编码），更一般地，可以顺序组织的数据（正式定义为矢量对象），以及视图在这些矢量对象上。还提供了高效的列表类，用于存储基本类的大型实例集。包中的所有类都使用一致的命名并尽可能共享相同的丰富和一致的“矢量API”。

作者：H.页面，P. Aboyoun和M. Lawrence

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此包，请启动R并输入：

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“IRanges”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“铁气”）

PDF.	r script.	讽刺的介绍
PDF.		参考手册
文本		新闻

细节

Biocviews.	DataRepresentation那基础设施那软件
版本	2.2.9
在生物导体中以来	BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.1.0），方法，UTI，统计数据，生物根系（> = 0.13.6），S4Vectors.（> = 0.6.1）
进口	统计数据4.
链接到	S4Vectors.
建议	xvector.那GenomicRanges那bsgenome.celegans.ucsc.CE2.那运行
SystemRequirements
加强
URL.
取决于我	BayesPeak那Biomvrcns.那生物仪器那Biseq.那bsgenome.那bsseq那bumphunter那咖啡店那卡斯珀那CexoR那ChIPpeakAnno那chipseq.那chroGPS那cn.mops.那CSAR.那customProDB那Dasir.那Deepsnv.那deseq2.那DEXSeq那DirichletMultinomial.那dmrcaller.那epigenomix那exomeCopy那FunciSNP.data那generxcluster.那GenomeInfoDb那基因组那GenomicAlignments那基因组法那基因组夫妇那GenomicRanges那凝皮膜那groHMM那Gviz那哈巴普那HiTC那HMMcopy那htSeqTools那德国兹那LiebermanAidenHiC2009那methyAnalysis那motifdb.那motifrg.那oneChannelGUI那OTUbase那pd.ag.那pd.aragene.1.0.st.那pd.aragene.1.1.st.st.那pd.ath1.121501那pd.barley1那pd.bovgene.1.0.st那pd.bovgene.1.1.st那pd.bovine那pd.bsubtilis那pd.cangene.1.0.st那pd.cangene.1.1.st那pd.canine那pd.canine.2那pd.celegans那pd.chicken那pd.chigene.1.0.st那pd.chigene.1.1.st.st.那pd.chogene.2.0.st.那pd.chogene.2.1.st那Pd.Citrus.那pd.cotton那pd.cyngene.1.0.st那pd.cyngene.1.1.st那Pd.cygene.1.0.st.那Pd.cygene.1.1.st.st.那pd.cytogenetics.Array.那pd.drogene.1.0.st.st.那pd.drogene.1.1.st.st.那pd.drosgenome1那pd.drosophila.2那pd.e.coli.2那pd.ecoli.那pd.ecoli.asv2那pd.elegene.1.0.st那pd.elegene.1.1.st那pd.equgene.1.0.st.st.那pd.equgene.1.1.st那pd.felgene.1.0.st那pd.felgene.1.1.st那Pd.fingene.1.0.st.st.那pd.fingene.1.1.st那pd.genomewidesnp.5.那pd.genomewidesnp.6.那pd.guigene.1.0.st.那pd.guigene.1.1.st.st.那pd.hc.g110.那pd.hg.focus.那pd.hg.u133.plus.2那pd.hg.u133a.那pd.hg.u133a.2那pd.hg.u133a.tag.那pd.hg.u133b.那pd.hg.u219那pd.hg.u95a.那pd.hg.u95av2.那pd.hg.u95b.那pd.hg.u95c.那pd.hg.u95d.那pd.hg.u95e.那pd.hg18.60mer.expr那pd.ht.hg.u133.plus.pm.那pd.ht.hg.u133a那pd.ht.mg.430A那pd.hta.2.0.那pd.hu6800那pd.huex.1.0.st.v2那pd.hugene.1.0.st.v1那pd.hugene.1.1.st.v1那pd.hugene.2.0.st.那pd.hugene.2.1.st.st.那pd.maize那pd.mapping250k.nsp.nsp.那pd.mapping250k.sty.那pd.mapping50k.hind240那pd.mapping50k.xba240那pd.margene.1.0.st.st.那pd.margene.1.1.st.st.那pd.medgene.1.0.st那pd.medgene.1.1.st那Pd.Medicago.那pd.mg.u74a那pd.mg.u74av2那pd.mg.u74b那pd.mg.u74bv2那pd.mg.u74c那pd.mg.u74cv2那pd.mirna.1.0那pd.mirna.2.0那pd.mirna.3.0.那pd.mirna.4.0.那pd.moe430a.那pd.moe430b.那pd.moex.1.0.st.v1那pd.mogene.1.0.st.v1那pd.mogene.1.1.st.v1那pd.mogene.2.0.st.那pd.mogene.2.1.st那pd.mouse430.2那pd.mouse430a.2那pd.mta.1.0.那pd.mu11ksuba.那pd.mu11ksubb.那pd.nugo.hs1a520180那pd.nugo.mm1a520177那Pd.ovigene.1.0.st.st.那pd.ovigene.1.1.st.st.st.那pd.pae.g1a那pd.plasmodium.anopheles那pd.poplar那pd.porcine那pd.porgene.1.0.st那pd.porgene.1.1.st那pd.rabgene.1.0.st那pd.rabgene.1.1.st那pd.rae230a.那pd.rae230b.那pd.raex.1.0.st.v1那pd.ragene.1.0.st.v1那pd.ragene.1.1.st.v1那pd.ragene.2.0.st.那pd.ragene.2.1.st.st.那pd.rat230.2那pd.rcngene.1.0.st那pd.rcngene.1.1.st那pd.rg.u34a.那pd.rg.u34b.那pd.rg.u34c.那pd.rhegene.1.0.st.st.那pd.rhegene.1.1.st.st.那pd.rhesus那pd.rice那pd.rjpgene.1.0.st那pd.rjpgene.1.1.st那pd.rn.u34那pd.rta.1.0.那pd.rusgene.1.0.st.st.那pd.rusgene.1.1.st那pd.s.aureus那Pd.soybean.那Pd.soygene.1.0.st.st.那pd.soygene.1.1.st.st.那pd.sugar.cane.那pd.tomato那pd.u133.x3p.那pd.vitis.vinifera那pd.wheat那pd.x.laevis.2那pd.x.tropicalis那pd.xenopus.laevis.那pd.yest.2.那pd.yg.s98那pd.zebgene.1.0.st.st.那pd.zebgene.1.1.st那pd.czebrafish.那百事可乐那p那proBAMr那PSICQUIC那r453plus1toolbox.那refnet.那RFPRED.那RGADEM.那rGREAT那RIPSeeker那rMAT那RSAMTOOLS.那SCSR.那Semmentseq.那SGSEQ.那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109那snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119那snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38那snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37.那SomatiCA那TEQC.那TitanCNA那tr那三层那VariantTools那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.那xvector.
进口我	AllelicImbalance那annmap.那ArrayExpresshts.那舞会礼服那bamsignals那BayesPeak那beadarray那生物仪器那biovizBase那Biseq.那BitSeq那bsgenome.那BubbleTree那蛋糕那cgdv17那冠军那魅力那chipenrich那chipenrich.data那ChIPQC那ChipSeeker.那chipseq.那chipseqr.那Chipsim那ChromHeatMap那切尔弗那cn那CNVRD2.那cobindR那彗星那COMPETOOLS.那骗子那CopyNumber.那撰稿人那CoverageView那CSAW.那customProDB那解码那derfinder那derfinderHelper那derfinderplot那困惑那diffHic那doqtl.那easyrnaseq.那edaseq.那面部那快速那拖鞋那Flowq.那FunciSNP那基因组那GenomicAlignments那基因组互动那GenomicTuples那genoset那GGBIO.那GGtools那girafe那gmapR那GoogleGenomics那哥特那gqtlstats.那Gwascat那H5VC那htseqgenie.那inpas.那intansv那IVAS.那M3D那mafdb.all.wgs.wgs.phase1.release.v3.20101123那mafdb.all.wgs.wgs.phase3.release.v5a.20130502那MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137那mafdb.exac.r0.3.site.那MatrixRider那冰雹那methVisual那methyAnalysis那甲基皮脂那MethylSeekR那methylumi那Minfi.那最小值那mmdiff那马赛克那motifrg.那MotIV那msa那MSnbase那ringerpeaks.那诊断那oligoclasses.那Pbase那pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1.那pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter那pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter.那pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter.那pd.atdschip.tiling那pd.charm.hg18.example.那pd.feinberg.hg18.me.hx1.那pd.feinberg.mm8.me.hx1.那pd.mirna.3.1.那pdinfobuilder.那Phastcons100way.ucsc.hg19.那Phastcons7way.ucsc.hg38.那图片那p那紫红色那Podkat.那聚酯纤维那预先那PVIZ.那QPGraph..那Quasr.那R3CPET.那r3Cseq那Rariant那Redseq.那RegionReport.那repitools.那ReportingTools那RGADEM.那rMAT那rnaseqmap.那rnbeads.那Rolexa那rqc.那rSFFreader那RSVSim那研制那rtracklayer那扫描。通用产品那SEQARRAY.那seqpattern.那seqplots那SEQVARTOOLS.那ShortRead那Skewr.那SNPchip那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109那snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119那snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38那snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38.那Soggi.那SomatiCA那SomaticCancerAlterations那Somaticsignatures.那拼接机那SplicingGraphs那svm2crm.那TFBSTools那Tracktables.那TransView那tr那TSSI.那VanillaICE那VariantAnnotation.那VariantFiltering那波兰人那挥舞车那xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38.那XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37那XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38那xvector.
建议我	BaseSpaceR那生物根系那gQTLBase那希尔伯塔维斯那HilbertVisGUI那海市蜃楼那S4Vectors.那斯坦那YeaStrnaseq.
构建报告

包档案

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包的来源	IRanges_2.2.9.tar.gz
Windows二进制	IRanges_2.2.9.zip(32位和64位)
Mac OS x 10.6（雪豹）	讽刺_2.2.9.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	讽刺_2.2.9.tgz.
Subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocondion-mirror/iranges/tree/release-3.1.
包短Url	http://biocidodder.org/packages/iranges/
包裹下载报告	下载数据