要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTqPCR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见HTqPCR.
Bioconductor版本:3.1
在多个条件或重复的高通量定量实时PCR (qPCR)分析Ct值。输入数据可以来自空间定义的格式,如ABI TaqMan低密度阵列或OpenArray;Roche应用科学公司的LightCycler;Bio-Rad实验室的CFX板;常规96孔或384孔板;或者微流控设备,如Fluidigm公司的动态阵列。HTqPCR处理数据加载、质量评估、归一化、可视化和参数或非参数测试,以确定特征(如基因、microRNAs)之间Ct值的统计显著性。
作者:Heidi Dvinge, Paul Bertone
维护者:Heidi Dvinge < Heidi at ebi.ac.uk>
引文(从R内,输入引用(“HTqPCR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTqPCR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HTqPCR”)
R脚本 | qPCR分析R | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MicrotitrePlateAssay,MultipleComparison,预处理,质量控制,软件,可视化,qPCR |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,RColorBrewer,limma |
进口 | affy,Biobase,gplots,图形,grDevices,limma、方法、RColorBrewer, stats, stats4, utils |
链接 | |
建议 | statmod |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.ebi.ac.uk/bertone/software |
全靠我 | |
进口我 | nondetects,unifiedWMWqPCR |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | HTqPCR_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | HTqPCR_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | HTqPCR_1.22.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | HTqPCR_1.22.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/HTqPCR/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HTqPCR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |