要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTqPCR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

HTqPCR

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见HTqPCR

自动分析高通量qPCR数据

Bioconductor版本:3.1

在多个条件或重复的高通量定量实时PCR (qPCR)分析Ct值。输入数据可以来自空间定义的格式,如ABI TaqMan低密度阵列或OpenArray;Roche应用科学公司的LightCycler;Bio-Rad实验室的CFX板;常规96孔或384孔板;或者微流控设备,如Fluidigm公司的动态阵列。HTqPCR处理数据加载、质量评估、归一化、可视化和参数或非参数测试,以确定特征(如基因、microRNAs)之间Ct值的统计显著性。

作者:Heidi Dvinge, Paul Bertone

维护者:Heidi Dvinge < Heidi at ebi.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“HTqPCR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HTqPCR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HTqPCR”)

PDF R脚本 qPCR分析R
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportDifferentialExpressionGeneExpressionMicrotitrePlateAssayMultipleComparison预处理质量控制软件可视化qPCR
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 BiobaseRColorBrewerlimma
进口 affyBiobasegplots,图形,grDevices,limma、方法、RColorBrewer, stats, stats4, utils
链接
建议 statmod
SystemRequirements
增强了
URL http://www.ebi.ac.uk/bertone/software
全靠我
进口我 nondetectsunifiedWMWqPCR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 HTqPCR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 HTqPCR_1.22.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) HTqPCR_1.22.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) HTqPCR_1.22.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/HTqPCR/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HTqPCR/
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