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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HTSFilter。

过滤器复制高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:3.1

这个方案实现了一个过滤程序复制转录组测序数据基于全球Jaccard相似性指数,以确定较低的基因,常数的表达水平在一个或多个实验条件。

作者:安德里亚劳梅丽娜Gallopin, Gilles Celeux,佛罗伦萨Jaffrezic

维护人员:安德里亚劳<安德里亚。劳在jouy.inra.fr >

安装

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文档

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PDF	R脚本	HTSFilter装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,Biobase(> = 2.27.3)、R (> = 3.2)
进口	DESeq(> = 1.19.0),刨边机(> = 3.9.14),DESeq2(> = 1.6.3)
链接
建议	EDASeq(> = 2.1.4),BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	HTSFilter_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	HTSFilter_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	HTSFilter_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	HTSFilter_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/htsfilter/tree/release - 3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
包下载报告	下载数据