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此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见HMMcopy。

拷贝数预测与修正的GC和可映射性偏差的HTS数据

Bioconductor版本:3.1

纠正了单个全基因组样本固定长度非重叠窗口中读取计数(即覆盖)的GC和可映射性偏差，为进一步分析产生拷贝数的粗略估计。设计用于高覆盖率全基因组肿瘤和正常样本的快速校正。

作者:Daniel Lai, Gavin Ha，索拉博沙阿

维护者:Daniel Lai ， Gavin Ha

安装

要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HMMcopy”)

文档

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browseVignettes(“HMMcopy”)

PDF	R脚本	HMMcopy
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,预处理,测序,软件,可视化
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0),IRanges(> = 1.4.16),geneplotter(> = 1.24.0)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	HMMcopy_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	HMMcopy_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	HMMcopy_1.10.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	HMMcopy_1.10.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/HMMcopy/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HMMcopy/
包下载报告	下载数据