要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HCsnip”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

HCsnip

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见HCsnip

层次聚类树的半监督自适应高度裁剪

Bioconductor版本:3.1

以现有患者随访信息为指导,以半监督的方式将给定的层次聚类树分解为不重叠的聚类。包含裁剪HC树、各种聚类质量评价标准、将新患者分配到给定的两个HC树之一、用排列参数检验聚类的显著性以及利用样本分子熵进行聚类可视化的功能。

作者:Askar Obulkasim

维护者:Askar Obulkasim

引文(从R内,输入引用(“HCsnip”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HCsnip”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HCsnip”)

PDF R脚本 HCsnip
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类GeneExpression微阵列软件aCGH
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10.0),生存硬币fpcclusterRepro嫁祸于randomForestSRCsmsigaRBiobase
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 HCsnip_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 HCsnip_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) HCsnip_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) HCsnip_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/HCsnip/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HCsnip/
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文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心