要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ generegionscan”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Generegionscan。
生物导体版本:3.1
专注于分析基因组离散区域的软件包。该软件包对于使用Affymetrix数据研究一个或几个基因很有用,因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级别数据,并将这些数据包装到ProbelevelSet中。probelevelset直接扩展了extressionset,但包括有关每个探针序列及其衍生的探针集的其他信息。该软件包包括许多用于绘制这些探针级别数据作为沿mRNA链序列的位置的函数的功能。这可用于分析可变剪接,并且特别适合与外显子数据数据一起使用。
作者:Lasse Folkersen,迭戈·迪兹
维护者:lasse folkersen
引用(从r内,输入引用(“ generegionscan”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ GenereGionscan”)
R脚本 | Generegionscan | |
参考手册 |
生物浏览 | DataImport,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,SNP,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.4(R-2.9)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 方法,生物酶(> = 2.5.5),生物弦 |
进口 | 生物酶(> = 2.5.5),affxparser,,,,rcolorbrewer,,,,生物弦 |
链接 | |
建议 | BSGENOME,,,,副词,,,,AnnotationDbi |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | generegionscan_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | generegionscan_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | generegionscan_1.24.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | generegionscan_1.24.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/generegionscan/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/generegionscan/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |