要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gwastools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Gwastools

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Gwastools

基因组广泛关联研究工具

生物导体版本:3.1

用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类,以及用于GWAS数据清洁和分析的功能。

作者:Stephanie M. Gogarten,Cathy Laurie,Tushar Bhangale,Matthew P. Conomos,Cecelia Laurie,Caitlin McHugh,Ian Painter,Xiuwen Zheng,Jess Shen,Rohit Swarnkar,Adrienne Stilp,Sarah Nelson,Sarah Nelson,Sarah Nelson

维护人员:stephanie M. Gogarten ,adrienne stilp

引用(从r内,输入引用(“ Gwastools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// urls(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gwastools”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gwastools”)

PDF R脚本 Gwastools中的数据格式
PDF R脚本 GWAS数据清洁
PDF R脚本 准备Affymetrix数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传因素,,,,微阵列,,,,QualityControl,,,,SNP,,,,软件
版本 1.14.2
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶
进口 方法,ncdf,GDSFMT,,,,DBI,,,,rsqlite,,,,gwasexacthw,,,,DNACOPIGY,,,,生存,,,,三明治,,,,lmtest,,,,logistf,,,,颤抖
链接
建议 Gwasdata,,,,生物基因,,,,运行,,,,Snprelate,,,,snpstats,,,,变体
系统要求
增强
URL
取决于我 创世纪,,,,Gwasdata
进口我
建议我 podkat
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 gwastools_1.14.2.tar.gz
Windows二进制 gwastools_1.14.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) gwastools_1.14.2.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) gwastools_1.14.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/gwastools/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gwastools/
软件包下载报告 下载统计

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