要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// urls(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gwastools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅Gwastools。
生物导体版本:3.1
用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类,以及用于GWAS数据清洁和分析的功能。
作者:Stephanie M. Gogarten,Cathy Laurie,Tushar Bhangale,Matthew P. Conomos,Cecelia Laurie,Caitlin McHugh,Ian Painter,Xiuwen Zheng,Jess Shen,Rohit Swarnkar,Adrienne Stilp,Sarah Nelson,Sarah Nelson,Sarah Nelson
维护人员:stephanie M. Gogarten
引用(从r内,输入引用(“ Gwastools”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Gwastools”)
R脚本 | Gwastools中的数据格式 | |
R脚本 | GWAS数据清洁 | |
R脚本 | 准备Affymetrix数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 遗传因素,,,,微阵列,,,,QualityControl,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 1.14.2 |
在生物导体中 | Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物酶 |
进口 | 方法,ncdf,GDSFMT,,,,DBI,,,,rsqlite,,,,gwasexacthw,,,,DNACOPIGY,,,,生存,,,,三明治,,,,lmtest,,,,logistf,,,,颤抖 |
链接 | |
建议 | Gwasdata,,,,生物基因,,,,运行,,,,Snprelate,,,,snpstats,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 创世纪,,,,Gwasdata |
进口我 | |
建议我 | podkat |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | gwastools_1.14.2.tar.gz |
Windows二进制 | gwastools_1.14.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | gwastools_1.14.2.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | gwastools_1.14.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/gwastools/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gwastools/ |
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