要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSRI”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GSRI

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见GSRI

基因集调控指数

Bioconductor版本:3.1

GSRI包估计基因集中差异表达基因的数量,利用基因集调控指数(GSRI)的概念。

作者:Julian Gehring, Kilian Bartholome, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring < Julian。Gehring at embl.de>

引文(从R内,输入引用(“GSRI”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GSRI”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GSRI”)

PDF R脚本 介绍GSRI包:利用基因集调控指数估计调控效应
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneRegulationGeneSetEnrichment微阵列软件转录
版本 2.16.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.14.2),fdrtool
进口 方法,图形,统计,utils,genefilterBiobaseGSEABase莱斯(> = 1.1.6)
链接
建议 limmahgu95av2.db
SystemRequirements
增强了 平行
URL http://julian-gehring.github.com/GSRI/
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GSRI_2.16.0.tar.gz
Windows二进制 GSRI_2.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GSRI_2.16.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) GSRI_2.16.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GSRI/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GSRI/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心