要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gseabase”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

gseabase

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅gseabase

基因集富集数据结构和方法

生物导体版本:3.1

该软件包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。

作者:马丁·摩根(Martin Morgan),塞思·法尔康(Seth Falcon)

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ gseabase”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ gseabase”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ gseabase”)

PDF R脚本 GSEABase简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,软件
版本 1.30.2
在生物导体中 Bioc 2.1(R-2.6)(8。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.6.0),生物基因(> = 0.13.8),生物酶(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3),方法,图形(> = 1.37.2)
进口 AnnotationDbi,,,,XML
链接
建议 HGU95AV2.DB,,,,go.db,,,,org.hs.eg.db,,,,rgraphviz,,,,报告工具
系统要求
增强
URL
取决于我 Agdex,,,,Bicare,,,,CPVSNP,,,,富集兄弟,,,,GCMAP,,,,GSVADATA,,,,NPGSEA,,,,承诺
进口我 癌症,,,,类别,,,,类别Compare,,,,CellHTS2,,,,gcmapweb,,,,GSRI,,,,GSVA,,,,HTSANALYZER,,,,莫格萨,,,,PCPHENO,,,,,,,,承诺,,,,报告工具
建议我 生物探测,,,,量规,,,,Globalancova,,,,全球测试,,,,gostats,,,,GSAR,,,,gsealm,,,,PGSEA,,,,
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 gseabase_1.30.2.tar.gz
Windows二进制 gseabase_1.30.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) gseabase_1.30.2.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) gseabase_1.30.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/gseabase/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gseabase/
软件包下载报告 下载统计

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