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哥特
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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅哥特。
二项测试高c数据分析
Bioconductor版本:3.1
这是一个高c分析包使用累积二项测试来检测远端基因位点之间的交互,更读的机会比预期高c实验。需要映射配对挥动读取列表作为输入,并回馈重要的对于一个给定的基因组中本大小的交互。
作者:Borbala Mifsud和罗伯特糖
维护人员:Borbala Mifsud < Borbala。在cancer.org.uk Mifsud >
从内部引用(R,回车引用(“哥特”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“哥特式”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“哥特”)
| package_vignettes.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 表观遗传学,嗝,预处理,测序,软件 |
| 版本 | 1.4.2 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R(> = 2.15.1)、方法、效用,GenomicRanges,Biostrings,BSgenome,data.table |
| 进口 | BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,ShortRead,rtracklayer,ggplot2 |
| 链接 | |
| 建议 | HiCDataLymphoblast |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | HiCDataLymphoblast |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | GOTHiC_1.4.2.tar.gz |
| Windows二进制 | GOTHiC_1.4.2.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOTHiC_1.4.2.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | GOTHiC_1.4.2.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gothic/tree/release - 3.1 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOTHiC/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
