安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSim”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSim。
Bioconductor版本:3.1
这个方案实现了几个函数用于计算相似性和基因产品基于他们的注释。而且它允许计算富集分析
作者:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >
维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >
从内部引用(R,回车引用(“GOSim”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSim”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GOSim”)
R脚本 | GOsim | |
参考手册 |
biocViews | 聚类,去,通路,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | GO.db,注释 |
进口 | org.Hs.eg.db,AnnotationDbi,topGO,集群,flexmix,RBGL,图,矩阵,corpcor,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | igraph |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GOSim_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOSim_1.6.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOSim_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛) | GOSim_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/gosim/tree/release - 3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSim/ |
包下载报告 | 下载数据 |